La première école au Caire fut créée par Mohamed Ali à la Citadelle. En effet, à la suite du massacre des Mamelouks le 1er mars 1811, Mohamed Ali créa une école à la Citadelle pour la formation générale des futurs officiers de l’armée.
L’Italien Costi enseignait le dessin et les mathématiques dans cette école. Des professeurs de français et de turc y donnaient encore des cours de langues. La création de cette école militaire de la Citadelle fut à l’origine de nombreuses autres fondations scolaires, au Caire et à Alexandrie, avant de s’étendre dans toutes les grandes villes d’Egypte.
Jusqu’au XIXème siècle, l’enseignement en Egypte était essentiellement religieux et était donné dans les écoles coraniques et c’est à travers lui que les élèves apprenaient à lire et à écrire. Ces écoles coraniques, les fameux “kouttab”, se trouvaient souvent au-dessus ou près d’un “sébile”, ces fontaines publiques et ces “sébiles kouttab” de par leur construction sont de véritables chefs-d’oeuvre de l’art islamique des différentes époques. L’enseignement était donné par des cheikhs d’El-Azhar dont l’université datait du Xème siècle. Pour les Chrétiens, l’enseignement était donné dans les églises. Mais à l’enseignement religieux, s’était ajouté celui des mathématiques, des sciences et d’autres matières. Dans les églises coptes, l’enseignement religieux était assuré par des moines et avec la religion ils ajoutaient l’écriture, la lecture et la morale dans les deux langues copte et arabe. Les prêtres, quant à eux, étaient souvent illettrés, les seules conditions requises pour l’ordination sacerdotale étant d’avoir une bonne vie morale, une belle voix et de connaître les textes liturgiques par cœur. Ce fut le patriarche réformateur Cyrille IV (1862-1870) qui créa les premières écoles coptes, une dizaine, au Caire et à Alexandrie. Il créa aussi un séminaire pour la formation du clergé.
De nombreuses écoles coraniques disparurent en 1838 à la suite d’une loi soumettant toutes les écoles primaires égyptiennes au contrôle du gouvernement.
La première véritable école, de style européen pour ainsi dire, fut fondée au Caire en 1732 par les Franciscains du Mousky en vue de l’enseignement de la langue italienne.
Mohamed Ali, dès son arrivée au pouvoir, s’employa à organiser l’enseignement dans de nombreuses écoles, mais il faudra attendre le règne du Khédive Ismaïl pour voir se constituer un enseignement solide et supervisé par le gouvernement.
En 1825, le Dr Clot bey proposa à Mohamed Ali de fonder une école de médecine et d’enseignement de la langue française. Cette école ouvrit ses portes en 1827. Par la suite, il fonda une école de langue française séparée de l’école de médecine qui fonctionna au niveau des études supérieures.
Les écoles normale, d’agriculture, de droit et de polytechnique, érigées en Universités en 1908, enseignaient aussi la langue française.
En 1863, le Khédive Ismaïl chargea Chérif pacha de la surveillance de l’instruction publique. Il fut assisté d’un Comité formé de directeurs d’écoles, de professeurs et de fonctionnaires. Chérif pacha et ses successeurs, comme Ali pacha Moubarak, imprimèrent un grand élan à l’instruction publique grâce à ce Comité qui fut le premier ministère de l’Enseignement en Egypte.
Sous le ministère d’Ali pacha Moubarak, qui fut ministre de 1868 à 1870, fut décrétée, en 1868, une loi répartissant les établissements d’enseignement en trois catégories d’écoles: primaires, secondaires et supérieures. Toutescesécolespubliquesétaientpresquegratuitesetellesétaientsubventionnées par le ministère de l’Instruction publique. Son budget, qui était de 6.000 livres égyptiennes à l’époque du vice-roi Saïd pacha, atteignit la somme de 75.000 livres égyptiennes avec le Khédive Ismaïl.
A l’époque du Khédive Ismaïl, huit grandes écoles supérieures existaient en Egypte: Ecole de polytechnique du Caire fondée en 1866 pour former des ingénieurs civils et militaires. Ecole de médecine et de pharmacie fondée par Clot bey en 1827 à Abou Zaabal et transférée en 1837 à Qasr El-Aïni au Caire. Ecole d’obstétrique qui fut annexée à l’Ecole de médecine. Ecole de droit et d’administration fondée en 1868 pour continuer l’Ecole des langues instituée par Mohamed Ali. En 1886, elle prit le nom d’Ecole de droit. Depuis ses origines et jusqu’en 1891, cette Ecole fut dirigée par le Français Vidal. Maison des sciences instituée au Caire en 1872 en vue de préparer des professeurs d’arabe pour les écoles élémentaires et secondaires. L’Ecole des arts et métiers de Boulac fondée en 1868 en vue de préparer des ouvriers spécialisés.